Профессиональная деятельность Алексея Трефилова в органах прокуратуры насчитывает четверть века. За этот период он прошёл путь от работы в районных отделах до руководящих должностей в прокуратуре Кемеровской области. В 2024 году ему было доверено возглавить прокуратуру Заводского района города Кемерово.
Ранее он занимал пост прокурора города Киселевска, а также руководил прокуратурой Прокопьевского района. За годы службы Алексей Трефилов неоднократно удостаивался благодарностей и наград, включая поощрения от Генерального прокурора Российской Федерации и прокурора Кемеровской области – Кузбасса, что свидетельствует о высоком уровне его профессионализма и ответственности.